Родился в семье кузнеца. После смерти родителей воспитывался теткой, потом дядей.
1921 г. - Ученик парикмахера, затем сапожника в г. Витебске.
1922 г.- Принят воспитанником в Витебский детский дом.
1929 г. - Коломенская совпартшкола. По окончании работал инструктором Коломенского райкома партии.
1932 г. - По партийной мобилизации направлен на партийно-политическую работу в РККА. Секретарь комсомольской организации зенитного полка, политрук роты, инструктор политотдела стрелковой дивизии, военный комиссар стрелкового полка.
1938 г. - Окончил курсы при политуправлении Харьковского военного округа. За отличную учебу и активную общественную работу получил благодарность от командования, а от политуправления - именные часы с надписью «За особые успехи в овладении большевизмом».
Август 1938 г. - Военный комиссар 23-й Харьковской ордена Ленина Краснознаменной стрелковой дивизии.
Сентябрь 1939 г. - В составе дивизии участвовал в походе в Западную Украину.
Лето 1940 г. - В составе дивизии вступил на территорию Латвии и расположился в Даугавпилсе.
Март 1941 г. - По незаслуженному обвинению переведен в Брест на должность заместителя командира 84-го стрелкового полка 6-й Орловской Краснознаменной стрелковой дивизии.
22 июня 1941 г. - Возглавил оборону Брестской крепости в кольцевой казарме на участке у Холмских ворот.
24 июня 1941 г. - Заместитель командира штаба обороны крепости.
30 июня 1941 г. - В плену выдан предателем и расстрелян у Холмских ворот крепости
3 января 1957 г. - Указом Президиума Верховного Совета СССР посмертно награжден орденом Ленина.
8 мая 1991 г. - По ходатайству ветеранов 23-й дивизии Министр обороны СССР отменил пункт приказа 1941 года о применении к Е. М. Фомину незаслуженного взыскания и восстановил его в должности заместителя командира дивизии.